癌症背后谁在操控细胞功能?( 五 )

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图4捕获区域内的相互作用热图

4|乳腺癌[5]

样本:乳腺癌细胞系MCF-7和乳腺上皮细胞系MCF-10A

多组学关联:Hi-C、RNA-seq

主要结论:

小染色体中(16-22号染色体)MCF-10A细胞系中有较强的基因相互作用 。 MCF-10A、MCF-7染色体中部分A/Bcompartment结构发生传化 , 这些转化区域中的很多基因和癌症重要通路WNT相关 。 鉴定TAD边界 , 发现乳腺癌细胞系特有的TAD边界 。

癌症背后谁在操控细胞功能?

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图5A/Bcompartment差异分析

5|前列腺癌[6]

样本:正常前列腺上皮细胞PrEC和2个前列腺癌细胞系PC3、LNCap

多组学关联:Hi-C、RNA-seq、ChIP-seq


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